Interiøret i en ortodoks kirke er vanligvis delt inn i tre deler: narthex, hoveddelen og alteret. Alteret er tempelets helligste sted. Det er der miraklet med å bruke brød og vin til Jesu Kristi legeme og blod skjer.
I den ortodokse kirken er alteret skilt fra hovedrommet for tilbedere av en vegg med ikoner kalt ikonostasen. Alteret i seg selv okkuperer et mindre område enn hoveddelen av templet, der de troende er til gudstjeneste. Siden alteret er det helligste stedet i templet, er inngang til det bare tillatt for prester og mennesker som har den spesielle velsignelsen fra presteskapet.
I midten av alteret er den hellige tronen. Det er på den at eukaristens sakrament blir utført under den guddommelige liturgi. En prest står foran tronen under en tjeneste. På selve tronen er alterkors, evangeliet, antiminer, så vel som gavevakten og lampen. I gavevakten er det tørkede hellige gaver til nattverd med troende hjemme.
I den nordlige delen av alteret til den ortodokse kirken er det et alter. Det er på det at presten begår en proskomidia, tilbereder brød og vin til nadverden til eukaristien. På et visst punkt i liturgien overføres uinnvidde brød og vin til tronen.
En integrert del av det ortodokse alteret er en menorah, som ligger bak tronen nærmere den østlige delen. En menorah er en struktur av syv lamper eller stearinlys. Hvis menorahen er liten, kan den ligge på selve tronen. En lignende gjenstand lå fremdeles i alteret i tabellen til Det gamle testamente.
Den østlige veggen av alteret er dekorert med ikonet av Kristus frelseren. Oftest skildrer det hellige bildet Jesu Kristi oppstandelse. Denne delen av alteret kalles det høye stedet. Foran Frelserens ikon henger en lampe som oftest, og på det veldig høye stedet er det et sete for presteskapet.
I den sørlige delen av alteret er stedet for sensoren oftest arrangert. Det kan også være en elektrisk komfyr som alteret kan tenne på kull for sensoren.
Også i alteret kan det være plassert graver med hylsen til Jesus Kristus og den salige jomfru. Den spesifikke plasseringen av disse helligdommene er indikert av rektoren for templet.
Det skal bemerkes at det indre av alteret er dekorert med forskjellige ikoner eller veggmalerier. Plott av malerier og hellige bilder kan være forskjellige. Noen ganger er dette hendelser fra Det nye testamentets historie, i andre tilfeller - helliges, englers eller Guds mores ansikter.
